با عنایت به نقش بسیار مهم و تأثیرگذار مسکن در آرامش و امنیت خانواده‌ها و کارکرد آن، تأمین مسکن خانواده‌ها از جمله اولویت‌های مهم مؤسسه می‌باشد و کوشش می‌شود همه‌ساله بخشی از خانواده‌ها صاحب مسکن شوند.برای فراهم نمودن مسکن مددجویان در چند سال گذشته اقدامات مهمی توسط مؤسسه به اجرا گذاشته شده است. خدمات مسکن از بدو تاسیس تاکنون:۱. ساخت و خرید ۵۲۴ واحد ۲. تعمیرات ۶۰ واحد ۳. وام تعمیر مسکن ۷۳ مورد ۴. پرداخت اجاره بها و اقساط معوقه مسکن ۴۴ مورد ۵.مشارکت در ساخت ۱۱۳ واحد مسکن ویژه سیل‌زدگان از خانواده ایتام مسکن خانواده‌ها با توجه به شرایط آنان با یکی از روش‌های زیر تأمین می‌شود:۱. خرید واحدهای آپارتمانی کوچک و در شان خانواده در سطح کشور با هم‌افزایی کمیته امداد کشور و آورده خانواده۲. ساخت ساختمان برای خانواده‌هایی که دارای زمین می‌باشند اما توانایی ساخت ندارند۳. مشارکت در خرید زمین و ساخت واحد مسکونی۴. انجام تعمیرات مسکن۵. بازسازی مسکن‌هایی که نیاز به بازسازی دارد۶. اجاره موقت مسکن برای خانواده‌هایی که مسکن ملکی برایشان تأمین نشده است برنامه آینده ساخت و خرید مسکن:موسسه خیریه عترت بوتراب در نظر دارد با استفاده از فرصت‌های موجود در قالب مشارکت با بنیاد مسکن انقلاب اسلامی و کمیته امداد امام خمینی نسبت به خرید واحدهای کوچک برای باقی‌مانده خانواده‌های تحت‌پوشش خود اقدام نماید.هرچند با توجه به افزایش قیمت مصالح و هزینه ساخت و نهایتا افزایش قیمت واحدهای آپارتمانی در کل کشور، این امر با مشکلات فراوان روبرو خواهد بود، اما با اتکا به عنایت خاص باری‌تعالی، این مهم را راهبری خواهد کرد. ساخت ۷۵۷ واحد مسکونی برای خانواده‌های ایتام فاقد مسکن مناسبتفاهمنامه «ساخت واحد مسکونی برای خانواده‌های ایتام فاقد مسکن مناسب» با مشارکت کمیته امداد امام خمینی (ره) و سازمان برنامه‌وبودجه کشور و موسسه خیریه عترت بوتراب در پایان سال ۹۷ منعقد شده است. به موجب این تفاهم‌نامه، منابع مالی موردنیاز طرح به صورت کمک بلاعوض است که یک‌سوم آن از محل کمک‌های بلاعوض دولت، یک‌سوم از طرف کمیته امداد و یک‌سوم از طرف موسسه بوتراب تامین می‌شود. تا پایان نیمه اول سال ۱۴۰۰: تعداد ۳۹۳ واحد مسکونی در طرح مذکور احداث و تحویل خانواده‌های بوتراب شده است. اما متاسفانه بدلیل افزایش بی‌رویه قیمت زمین در تمام نقاط کشور، تعداد ۳۶۴ خانواده که فاقد زمین شخصی بوده و توانایی لازم در همیاری و تامین آورده جهت خرید واحد مسکونی را نداشته‌اند، باقی مانده است.